- vysokotlaká kapalinová chromatografie – HPLC systém (Agilent 1260 Infinity II a Agilent 1200, Agilent Technologies); UV-VIS absorpční, fluorescenční a refraktometrická detekce, sběrač frakcí
- vybavení pro elektroforetickou separaci biomolekul (nativní i denaturující PAGE; Hoefer, Biorad) se zobrazovacím zařízením ChemiDoc MP (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA)
- vybavení pro western-blotting (Bio-Rad Laboratories, USA)
- malé stolní laboratorní centrifugy (Hettich, Německo)
- vysokootáčkové chlazené centrifugy (Sigma 3K30, Německo)
- chlazený vakuový koncentrátor CentriVap (Labcocno, USA)
- mechanické homogenizátory (IKA), ultrazvukový homogenizátor (GM 3100; Bandelin Electronic, Berlín, Německo)
1) Laboratoř biochemických analýz
2) Laboratoř spektrálně-optických metod
- spektropolarimetr pro měření cirkulárního a lineárního dichroismu J-815 (Jasco, Tokio, Japonsko); spektropolarimetr je vybaven držákem kyvet s Peltierovým termostatem, fotonásobičem se zvýšenou citlivostí v červené oblasti stektra (350 – 870 nm) nebo průtočnou kyvetou pro propojení HPLC-CD
- modularní spekrofluorimetr Fluorolog 3-22 (Jobin-Yvon, Francie); spekrofluorimetr je vybaven držákem kyvet s Peltierovým termostatem, příslušenstvím pro měření anizotropie fluorescence, programovatelným kryostatem OPTISTAT DI (Oxford Scientific, UK) nebo nádobou Dewarova typu pro nízkoteplotní měření.
- luminiscencční spekrofluorimetr LS50B (Perkin-Elmer, Beaconsfield, Velká Británie) nádobou Dewarova typu pro nízkoteplotní měření.
- dvoupaprskový absorpční spektrofotometr UV550 (Unicam, UK)
- dvoupaprskový absorpční spektrofotometr Specord 250 (Analytik Jena, Německo) včetně držáku kyvet s Peltierovým termostatem
- jednopaprskový UV-VIS spektrofotometr s diodovým polem Specord S 600 (Analytik Jena, Německo) se sondou s optickým vláknem pro měření mimo kyvetový prostor spektrofotometru
3) Laboratoř ekofyziologie fotosyntézy
- růstové komory pro kultivaci rostlin při definovaných mikroklimatických podmínkách (ozářenost, teplota a vlhkost vzduchu) (HB 1014, VB 1014, Vötsch, Německo); komory jsou vybaveny halogenovými lampami s možností přídavného modulu s UV-A a UV-B lampami
- růstové komory s možností regulovat spektrální složení fotosynteticky aktivního záření (s využitím LED diod s vyzařováním v červené, zelené a modré spektrální oblasti) (Fytoscope FS 130, Photon Systems Instruments, ČR)
- měřící systém DUAL-PAM-100 (Heinz Walz, Německo) pro analýzu funkčního stavu fotosystému II a I pomocí měření fluorescence chlorofylu a redoxního stavu primárního donoru elektronů fotosystému I (P700); systém je vybaven také modulem pro měření elektrochromního posuvu pigmentů a rozptylu (P515/535)
- měřící systémy detekce fluorescence chlorofylu ke stanovení využití absorbované energie ve fotosyntetických reakcích (PAM 101-103, PAM 2500, XE-PAM, zobrazovací systémy IMAGING-PAM M-Series – MAXI, MINI a MICROSCOPY verze, Heinz Walz, Německo), FluorPen FP 100 (Photon Systems Instruments, ČR), FMS-300 (Hansatech Instruments, UK)
- kinetický spektrometr Joliotova typu JTS-100 (BioLogic, Grenobl, Francie); systém umožňuje provádět měření elektrochromního posuvu absorbance pigmentů (ΔA520), redoxní studie P700 (na základě absorpčních změn při 705 nm i 810 nm) a plastocyaninu, cytochromu b6f eukaryot, měření nefotochemického zhášení fluorescence chlorofylu nebo velmi rychlého fluorescenčního indukčního jevu (OJIP)
- UV-NIR spektroradiometry HR4000CG‑UV‑NIR a HR4XR500-10 včetně integrační sféry (Ocean Optics, USA) pro měření intenzity a spektrálních charakteristik dopadajícího záření a měření spektrálně-optických vlastností rostlin
- přenosný optický senzor Dualex 4 Scientific (Force-A, Francie) pro nedestruktivní stanovení obsahu flavonolů v epidermu listů na základě detekce fluorescence chlorofylu (excitované v UV-A a červené oblasti spektra) a současné stanovení obsahu chlorofylu na základě měření transmitance listu za použití záření v blízké infračervené oblasti spektra
- přenosný analyzátor LSA-2050 (Heinz Walz, Německo) pro neinvazivní stanovení maximálního fotochemického kvantového výtěžku fotosystému II (FV/FM) a obsahu flavonoidů, antokyanů a chlorofylu v listech
- otevřený gazometrický systém Li-6400 (Li-Cor, USA) pro měření fotosyntetických charakteristik asimilačního aparátu (např. rychlost asimilace CO2, stomatální vodivost)
- aparatury pro měření vývoje (spotřeby) kyslíku při fotosyntéze (respiraci) v plynné fázi (listy) i kapalné fázi (suspenze chloroplastů) využívající kyslíkovou elektrodu (Hansatech, UK)
- zdroj záření s xenonovou výbojkou MAX-303 (Asahi Spectra Co., Ltd., Japonsko) produkující záření s vysokou intenzitou v úzkých spektrálních intervalech (10 nm FWHM)
- Scholanderova bomba – systém pro měření vodního potenciálu u rostlin (3005F01, Soilmoisture Equipment Corp., Santa Barbara, CA, USA)
- systémy pro měření spektrální kvality dopadajícího záření, teploty a vlhkosti vzduchu, půdní teploty a vlhkosti a teploty asimilačního aparátu (EMS, ČR)